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如何配置ProteinLynx Global Server 3.0.3 以使用 NVIDIA Quadro GPU - WKB52140

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文章编号: 52140点击此处访问英文版本文章

目的

启用ProteinLynx Global Server (PLGS) 3.0.3，以使用支持计算统一装置架构 (CUDA) 的 NVIDIA Quadro 系列图形处理器单元 (GPU) 加速 MSe、HD-MSe 和 SONAR 数据处理。

 

环境

  • PLGS3.0.3
  • Windows 7
  • Windows 10
  • 基于 Lenovo P720 的 PLGS 处理 PC
  • 基于 Lenovo P720 的 NLD Stage 2 LM 处理 PC（用于蛋白质组学的 Progenesis QI）
  • 基于 Lenovo P520 的 NLD Stage 1 LM 处理 PC（用于蛋白质组学的 Progenesis QI）

步骤

  1. 在 Windows 搜索栏中键入“设备管理器”
  2. 打开“设备管理器”，在装置类型列表中选择“显示适配器”
  3. 检查已安装的 GPU 并记下已安装的 GPU
    1. 在基于 Lenovo P720 的 PLGS 处理 PC 或基于 P520 的 NLD Stage 1 Large Mol PC 中，其中一个 GPU 应为 NVIDIA Quadro P5000 或 NVIDIA Quadro RTX 5000。
  4. 关闭 PLGS3.0.3
  5. 打开 C:\PLGS3.0.3\lib\apex3d\
  6. 检查该文件夹中是否有任何现有的 Apex3D64_params.txt 文件
    1. 如果没有现有的命令文件
      1. 打开一个新的文本文件。

      2. 如果您在步骤 3 中找到了 Quadro P5000，请键入 -preferredGPU P5000

      3. 如果您在步骤 3 中找到了 Quadro RTX 5000，请键入 -preferredGPU RTX 5000

      4. 将命令文件另存为 C:\PLGS3.0.3\lib\apex3d\Apex3d64_params.txt

注意上述命令的类型必须与上图所示完全相同

  1. 如果有 Apex3D64_params.txt，
    1. 在记事本等文本编辑器中打开该文件。
    2. 删除任何现有的“-preferredGPU”命令
    3. 在任何其它命令下方，键入 GPU 的相关命令
    4. 保存命令文件

 

  1. 重新启动 PLGS3.0.3

附加信息

PLGS 最初的开发目的是仅使用 NVIDIA Tesla 系列 GPU 进行 MSe 处理。 NVIDIA 越来越多地将 Tesla 系列卡作为“仅服务器”产品进行销售。服务器 GPU 不能用于工作站 PC，因为由于缺少专用的板载 GPU 冷却风扇，它们往往会过热。但是，大多数 NVIDIA GPU 现在都已启用 CUDA。因此，PLGS 理论上可以配置为使用其它 NVIDIA GPU，只要它们有足够的板载专用 GPU RAM（推荐 12 GB）。但您必须按照本文所述的方式，使用命令文件明确告知 PLGS 允许使用非 Tesla GPU。

本文中所述的命令仅适用于 PLGS3.0.3。不适用于 PLGS 3.0.2 或更早版本

id52140, SUPPLGS