CONFIRM Sequence 应用程序无法处理硫代磷酸酯序列 - WKB305263
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故障描述
- 在分析中使用硫代磷酸酯连接的寡核苷酸序列时,CONFIRM Sequence 无法处理数据
- 如果使用磷酸二酯连接的寡核苷酸序列,则可以处理相同的数据
环境
- waters_connect 3.6.0
- waters_connect 3.7.0
- CONFIRM Sequence 1.4.0
原因
Confirm Sequence(确认序列)1.4.0 与waters_connect基本套件 3.6.0 和 3.7.0 之间不兼容
硫代磷酸酯单体 ID 带有星号 (*)。 waters_connect 3.6.0 和 3.7.0 中使用的 Platform Services 版本不接受 Confirm Sequence(确认序列)的单体 ID 字段中存在星号,因此处理会失败。
解决方法
就地升级waters_connect 4.0.0。
注:由于此问题是由基本套件中的功能引起的,因此使用waters_connect 3.7.0 安装同一版本的 Confirm Sequence(确认序列)无法处理硫代磷酸酯序列,而安装waters_connect 4.0.0 时可以成功处理硫代磷酸酯序列。
附加信息
此问题仅影响所列版本的waters_connect基本套件。在 waters_connect 3.2.0 中不会出现此问题,此问题已在waters_connect 4.0.0 中修复。
在受影响的版本中,也可以通过手动创建一组备用硫代磷酸酯单体来解决此问题。
- 打开 Synthetic Library 应用程序。
- 打开 Monomers 库。
- 对于每个硫代磷酸酯单体(即 ID 字段中带有 * 的单体):
- 克隆单体。
- 编辑 ID 字段,使其仅包含字母数字字符。例如:对于脱氧腺苷硫代磷酸,将 ID 从“dA*”更改为“dAs”。
- 保存编辑后的克隆单体。
- 打开寡核苷酸序列库。
- 编辑每个包含硫代磷酸酯单体的序列,将包含星号的序列替换为步骤 3 中创建的序列。
- 打开 mRNA Library(mRNA 库)。
- 编辑每个包含硫代磷酸酯单体的序列,将包含星号的序列替换为步骤 3 中创建的序列。
如果客户在使用上述解决方法后升级到waters_connect 4.0.0,他们可以继续使用自己创建的硫代磷酸酯单体,也可以继续使用安装 Confirm Sequence 1.4.0 时安装的缺省硫代磷酸酯单体。
waters_connect 3.6.0 和 3.7.0 中的问题已记录为 CRI-8171。
id305263, Oligonucleotide, SUPWC, upgrade