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解卷积碎片离子的光谱与“查看”中“碎片离子查看器”中的光谱有什么不同?- WKB99805

环境

  • UNIFI
  • 肽图分析

答案

“碎片离子查看器”中的质谱按照如下步骤显示。

首先,分别使用“功能 1”的(碰撞电压)低能量数据和 “功能 2”的(碰撞电压)高能量数据执行峰检测。

m/z 轴、保留时间轴和强度的三维数据中,如果检测到具有三维山形状的峰,则会将其检测为峰。

经过一段时间检测到的峰(例如流动相杂质)不会识别为峰。

此外,对于可检测的峰的最小强度,分析方法中的以下设置为阈值:

“处理”选项卡 >“查找 3D 峰”>“(高能量/低能量)强度阈值”

当“研究”界面上的光谱进行积分时,经过一段时间后检测到的峰或如上所述强度低的峰也将进行积分。

 


接下来,将保留时间相同的母离子峰(功能 1)和子离子峰(功能 2)相关联,并使用 MaxEnt3 执行解卷积。
此处使用的是以下分析方法的设置:

“处理”选项卡>“3D 同位素簇”> 创建簇期间和高至低能量关联期间要应用的色谱峰宽分数

这是收集同位素离子的光谱峰关联母离子和子离子时,保留时间差可接受值的设置。

根据馏分设置色谱峰的半宽度。

 

“处理”选项卡 >“3D 同位素簇”> 创建簇期间和高至低能量关联期间要应用的色谱峰宽分数
设置关联母离子和子离子时应用的峰强度阈值。

当在“研究”屏幕上对碎片离子的光谱进行积分时,光谱将包含混合物,混合物是从具有相似保留时间的母离子碎片离子中衍生而来的。

屏幕也会显示所有低-强度峰。

附加信息

 

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