如何在 UNIFI 科学库中创建自定义氨基酸 - WKB191444
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目的
在 UNIFI 科学库中创建自定义氨基酸。
环境
- UNIFI
- waters_connect
步骤
- 按照 KCS 文章:如何在 UNIFI 的自定义库中创建条目 - WKB26968 中的说明创建一个新的库条目,并在必要时创建一个新的自定义库如何在 UNIFI 的自定义库中创建条目 - WKB26968
- 在 Web 浏览器中,转到 https://www.chemspider.com/,搜索要添加到库中的天然氨基酸[1]
- 如果自定义氨基酸在 Chemspider 数据库中,请从搜索结果中下载 .mol 文件
- 完成以下步骤。
waters_connect
- 在waters_connect Hub 中,打开 Administration 应用程序并选择 Manage Libraries(管理库)
- 在“管理”>“科学库”>“管理库条目”中,选择“创建库条目”
- 在条目名称字段中键入自定义氨基酸的名称,然后从“库”下拉列表中选择要添加的自定义库
- 如果有自定义氨基酸的 .mol 文件,
- 在库条目编辑器中单击“工具”,然后从下拉菜单中选择“加载结构”
- 浏览到步骤 1 中下载的 .mol 文件,然后选择该文件。希尔公式、平均摩尔质量、单一同位素质量数和分子结构字段将自动填充
- 在库条目编辑器中单击“工具”,然后从下拉菜单中选择“加载结构”
- 如果没有自定义氨基酸的 .mol 文件,请在相关字段中输入化学式
- 在条目类型字段中,单击“值”,然后从出现的下拉菜单中选择氨基酸
- 在“属性”>“同义词”中,单击同义词类型框
- 从出现的菜单中选择三字母代码
- 在 Synonym(同义词)字段中输入修饰后氨基酸的三个字母代码,然后按 Return(返回)
- 在第二个同义词行中重复步骤 7 和 8,但这次选择 One Letter Code(一个字母代码)选项
- 在“同义词”字段中,输入非表示标准氨基酸的字母的单个字符。
- 您可以使用除 G、A、V、L、I、T、S、M、C、P、F、Y、W、H、K、R、D、E、N 或 Q 以外的任何字符,
- 您可以使用任何 ASCII 字符,包括数字和大多数标点符号。我没有测试过中文字符
- 我用的例子是英镑符号£
- 输入条目名称。现在显示的代码应如下图所示,尽管您可能选择了“Pound Sterling”以外的符号作为单个氨基酸代码。按 save(保存)按钮进行保存
UNIFI 1.9.4
- 从下拉菜单中选择氨基酸)条目类型
- 输入自定义氨基酸的化学式,或导入 .mol 文件自动填充结构和化学式字段
- 在“同义词”部分输入自定义氨基酸的三个字母和一个字母代码
附加信息
- 要添加氨基酸的结构,请按照 KCS 文章如何将小分子的结构添加到 UNIFI 科学库中 - WKB191442 中的步骤操作。
- 单击“工具”>“移除显式氢”,可以在结构中隐藏氢原子。
- 本文是有关 UNIFI 科学库(如何在 UNIFI 中建立和管理科学库 - WKB190999)的系列文章之一,也可以通过以下链接找到:先进的 UNIFI:科学库的建立和管理 (715007127)。
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