如何在 UNIFI 科学库中创建自定义氨基酸 - WKB191444

目的

在 UNIFI 科学库中创建自定义氨基酸。

环境

• UNIFI
• waters_connect

步骤

1. 按照 KCS 文章：如何在 UNIFI 的自定义库中创建条目 - WKB26968 中的说明创建一个新的库条目，并在必要时创建一个新的自定义库如何在 UNIFI 的自定义库中创建条目 - WKB26968
2. 在 Web 浏览器中，转到 https://www.chemspider.com/，搜索要添加到库中的天然氨基酸[1]
3. 如果自定义氨基酸在 Chemspider 数据库中，请从搜索结果中下载 .mol 文件
4. 完成以下步骤。

waters_connect

1. 在waters_connect Hub 中，打开 Administration 应用程序并选择 Manage Libraries（管理库）
2. 在“管理”>“科学库”>“管理库条目”中，选择“创建库条目”
3. 在条目名称字段中键入自定义氨基酸的名称，然后从“库”下拉列表中选择要添加的自定义库
4. 如果有自定义氨基酸的 .mol 文件，
   1. 在库条目编辑器中单击“工具”，然后从下拉菜单中选择“加载结构” 
   2. 浏览到步骤 1 中下载的 .mol 文件，然后选择该文件。希尔公式、平均摩尔质量、单一同位素质量数和分子结构字段将自动填充
5. 如果没有自定义氨基酸的 .mol 文件，请在相关字段中输入化学式
6. 在条目类型字段中，单击“值”，然后从出现的下拉菜单中选择氨基酸 
7. 在“属性”>“同义词”中，单击同义词类型框

7. 从出现的菜单中选择三字母代码

8. 在 Synonym（同义词）字段中输入修饰后氨基酸的三个字母代码，然后按 Return（返回）
9. 在第二个同义词行中重复步骤 7 和 8，但这次选择 One Letter Code（一个字母代码）选项
10. 在“同义词”字段中，输入非表示标准氨基酸的字母的单个字符。
    1. 您可以使用除 G、A、V、L、I、T、S、M、C、P、F、Y、W、H、K、R、D、E、N 或 Q 以外的任何字符，
    2. 您可以使用任何 ASCII 字符，包括数字和大多数标点符号。我没有测试过中文字符
    3. 我用的例子是英镑符号£
11. 输入条目名称。现在显示的代码应如下图所示，尽管您可能选择了“Pound Sterling”以外的符号作为单个氨基酸代码。按 save（保存）按钮进行保存

 

UNIFI 1.9.4

1. 从下拉菜单中选择氨基酸）条目类型
2. 输入自定义氨基酸的化学式，或导入 .mol 文件自动填充结构和化学式字段
3. 在“同义词”部分输入自定义氨基酸的三个字母和一个字母代码 

附加信息

• 要添加氨基酸的结构，请按照 KCS 文章如何将小分子的结构添加到 UNIFI 科学库中 - WKB191442 中的步骤操作。
• 单击“工具”>“移除显式氢”，可以在结构中隐藏氢原子。
• 本文是有关 UNIFI 科学库（如何在 UNIFI 中建立和管理科学库 - WKB190999）的系列文章之一，也可以通过以下链接找到：先进的 UNIFI：科学库的建立和管理 (715007127)。