ProteinLynx Global Server（蛋白定量和蛋白鉴定软件）如何计算符合筛选条件的置信限？- WKB9217

环境

• ProteinLynx Global Server（蛋白定量和蛋白鉴定软件）

答案

计算法则在以下同行评审论文中进行了说明，研究人员经常引用这些论文来发表使用 PLGS 生成的结果。

但是，分数不是硬性值；它取决于数据。还附上了一种概率类型的计算，在概念相似性方面类似于蛋白质预测，以提供置信度 - 绿色（概率 > 95%）、琥珀色（概率为 50%-95%）、红色（概率 < 50%）。

Database searching and accounting of multiplexed precursor and product ion spectra from the data independent analysis of simple and complex peptide mixtures, Li et al. Proteomics 2009, 9, 1696–1719.

A Statistical Model for Identifying Proteins by Tandem Mass Spectrometry. Nesvizhskii et al. Anal. Chem. 2003, 75, 4646-4658.

附加信息