Progenesis QI for Proteomics 版本 3 MSe 处理暂停 - WKB55784
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故障描述
- MSe、HD-MSe 或 SONAR 数据处理中蛋白质组学数据分析软件版本 3 的 Progenesis QI 挂起
- 正在使用计算机上的所有 RAM,因此计算机通常运行缓慢且无响应
- 如果打开 Windows“任务管理器”,转到“处理”选项卡并按 RAM 使用情况排序,一个名为 peptide3D.exe 的进程正在占用几乎所有可用的 RAM
环境
- Progenesis 蛋白质组学 QI 版本 3
注意 - 此问题为版本 3 的特有问题。此问题已在版本 4 及更高版本中纠正
原因
Peptide3D.exe在MSe处理期间使用的缺省低能量到高能量峰匹配设置意味着peptide3D需要大量RAM,尤其是在Apex3D阈值因未正确优化而过低时。因此,即使具有 64 GB RAM 的 PC 也可能难以处理某些数据集。这些设置无法从 Progenesis QI for Proteomics 中配置,但可以使用命令文件进行修改。
解决方法
- 将附件 Peptide3D_params.txt 文件保存至 C:\Program Files (x86)\ 非线性动力学\ 蛋白质组学数据分析软件Progenesis QI\Plugins\WatersRawFolderReader\Processing\
- 针对正在处理的数据优化 Apex3D 阈值(请参阅 WKB1232),然后重新处理数据。使用 PLGS Threshold Inspector 优化 MSe 谱图处理参数 - WKB1232
附加信息
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