PLGS3.0.3 可以导出 mzIdentML 格式的数据,PRIDE 接受以此格式提交的数据。

其他版本的 PLGS 无法导出 mzIdentML 数据,并且 EBI 已更改 PRIDE 标准,因此我们的插件导出的数据不再符合标准。

  • PRIDE 可以接受 Pride XML 格式和 mzIdentML 格式的结果和数据。请参阅 PRIDE Archive ProteomeXchange guidelines(《PRIDE Archive ProteomeXchange 指南》)。
  • 从 PLGS 3.0 开始,PLGS 随附 Pride 导出插件。
  • 但是,PLGS3.0 和 PLGS3.0.1 随附的 Pride 插件无法正常工作。
  • PLGS3.0.2 和 PLGS3.0.3 随附的 Pride 插件本来可以正常工作,直到欧洲生物信息研究所单方面更改了格式要求,导致我们的插件无法正常工作。
  • 只有 PLGS3.0.3 可以导出 mzIdentML 格式的数据。
  • 由于 PLGS3.0.3 可以导出 mzIdentML 格式的数据,因此我们没有修复 Pride 插件的计划。
  • 如果早期版本 PLGS 的用户需要将数据提交至 PRIDE 存档,则必须升级至 PLGS3.0.3。