如何使用 MS 3D 扣除功能去除背景干扰 - Tip111

目的

欢迎回到 Get Empowered！在上一次有关 Empower 色谱数据软件的 Empower 每周一贴中，我们学习了使用 CODA（组分检测算法）工具帮助搜索峰 (Tip #110)。

本周，我们将学习 MS 3D 扣除。如果用户的 QDa 检测器被聚乙二醇等物质污染，可能会干扰样品中的所有 MS 谱图。使用“处理方法”中的 MS 3D 扣除功能，用户可以减去背景光谱，消除干扰。

让我们开始吧！

环境

• Empower 软件

步骤

1. 我们首先在“查看”窗口中查看 3D MS 通道的 TIC 图。

2. 单击工具栏中的“3D 图”工具，或从“窗口”菜单中选择“3D 图”。该图 x 轴表示时间，y 轴表示强度，z 轴表示质量数。请注意，低质量数端的高强度以蓝色突出显示。

3. 在“处理方法”的“MS 3D 通道”选项卡中，我们可以启用“MS 3D 扣除”。我们来看看参数。

• 选择一个没有峰的基线区域执行扣除。勾选“启用 MS 3D 扣除”框，并在“减去”字段中输入一个或多个时间范围。输入时间范围时，使用冒号 (:) 分隔时间，使用分号 (;) 分隔多个时间范围。Empower 将根据输入的时间计算平均谱图，将该值从其他所有值中减去。
• 执行扣除之前，请指定乘以谱图的“值”。
• 指定一个“噪声阈值”，用于删除强度低于阈值的数据点。此值以基峰强度的百分比形式输入。
• Empower 使用“峰分离”组合该范围内的数据点，生成单质量数。例如，如果指定的值为 2，那么从 299 到 301 的所有质量数将组合成单质量数 300。

4. 返回“主窗口”并重新积分色谱图。从“2D 通道”选项卡中选择由扣除产生的通道，并将其重叠在原始 TIC 图上。请注意在 4.2 和 5 min 之间基线和峰的变化。

5. 在 2D 通道选项卡中选中具有基线扣除的色谱图，然后单击“3D 图”工具。可以看到低质量范围内的强度已降低。

6. 返回“处理方法”并输入“噪声阈值”的值。在“主窗口”中重新积分色谱图。在“查看光谱”窗口的“光谱”表中，只选中一个光谱。

7. 单击“光谱点”选项卡，以查看光谱中各点的质量和强度。如果比较使用“噪声阈值”之前和之后的光谱点表，可以发现点数差异。

就这么简单！

附加信息

• 用户也可以使用“衍生通道”执行 3D 扣除。为什么要区别使用“处理方法”或“衍生通道”呢？如果用户需要以相同的方式处理所有数据，可以使用处理方法。如果用户需要使用相同的“处理方法”处理数据，但要进行扣除的色谱图区域不同，可以使用“衍生通道”。
• 此步骤可用 QuickStart 或 Pro 界面完成。
• ACQUITY QDa 质谱检测器可与 Alliance HPLC 系统兼容。